Az 1901-ben alapított iskola 1950-től a Pécsi Pedagógiai Főiskola gyakorló iskolája lett, és követte az intézményt annak szervezeti és névváltozásai közepette a JPTE, majd PTE kötelékébe.
1951-ben a Pécsi Tudományegyetem egy karúvá válásával több kiszolgáló egységet, így a könyvtárat is kettéválasztottak. Ez a könyvtár működött ezután a Pécsi Tudományegyetemen, majd 1982-től a Janus Pannonius Tudományegyetemen, bővülve az új karok tematikájával, esetenként fiókkönyvtárakkal. A 2000-től az integrált Pécsi Tudományegyetem könyvtáraként működik tovább.
1951-ben az egy karúvá vált Pécsi Tudományegyetem rektori feladatait a jogi kar dékánja látta el. Valódi rektori hivatalról 1975-től beszélhetünk, amikor a Közgazdaságtudományi Kar is csatlakozott az egyetemhez. 1982-ben az intézmény a Tanárképző kar létrejöttével a Janus Pannonius Tudományegyetem nevet vette fel, ennek rektori hivatala egészen a 2000-es intergrációig működött.