Az állag két részből áll. Az Alföldi Bizottság a magyar Alföld növényföldrajzi viszonyainak, botanikai jellegzetességeinek feltárására jött létre 1909-ben, jórészt a kert akkori vezetőjének, Mágócsy-Dietz Sándor professzor kezdeményezésére, aki a bizottság elnöki tisztát is betöltötte. Iratanyagához van mutató, ennek felhasználásával kutatható.
Az állag másik fele személyi iratok gyűjteménye. Iskolai bizonyítványok, katonai, szolgálati iratok, esetenkénti magán- és hivatali levelek együttese.

Az állag jórészt a kerthez érkezett kérelmekből (szaktanács kérés, növények felajánlása megvételre stb.) áll. A külföldi levelezés a kert külkapcsolataihoz szolgálhat adalékul. A vegyes iratok a legkülönbözőbb jellegű iratok, prospektusok, újságkivágások gyűjteménye.

A tanszék iratait 1959-től tárgycsoportokat kialakítva, évenkénti sorszámos rendben iktatták. Ezek a tárgycsoportok: az oktatásügyi iratok, a gyógyszerészképzés, a tudományos kutatás, a személyi- és gazdasági iratok egyúttal a fond állagai is. A vegyes iratok állagát az előbbi tárgycsoportokba nem tartozó iratok alkotják. A tudományos kutatás című állag anyagában 1965 és 1970 között párhuzamosan iktattak. Az egyik rész a kutatásokkal kapcsolatos levelezést, míg a másik túlnyomórészt jelentéseket tartalmaz. A kutatást az "a/" állag kivételével iktatókönyvek segítik.

A fond anyaga az 1945 előtti korszakból rendkívül töredékesen maradt fenn. Az 1945 után keletkezett iratok egy részéhez nincsenek segédkönyvek, ezek hiányában az anyag egyenkénti átnézéssel kutatható.

Az anyag kutathatóságát nehezíti az a tény, hogy 1952-től témakörönként iktattak (pl. tanulmányi ügyek, rektori iratok, nemzetközi kapcsolatokra vonatkozó iratok), ugyanakkor a régi iktatást is folytatták. 1972-ben tértek rá az évenkénti sorszámos iktatásra. A tanszék irataihoz 1945-től maradtak fenn az iktatókönyvek